مهدی باقری به عنوان کارگردان در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
ناگهان تو گم شدی درباره آن است که: در این فیلم مستند مقاومت 35 روزه خرمشهر، شرایط و زندگی مردم را از طریق گزارش های روزانه بهروز مرادی مرور می کنیم. در این فیلم مهدی باقری با فرحناز شریفی, محمدرضا جهان‌پناه, مهرشاد ملکوتی, مهدی کوهیان همکاری کرده است.
