محمد حسینی به عنوان کارگردان در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
طرلان درباره آن است که: فیلم روایتگر پسری به نام طرلان است که در جریان اتفاقات و رویدادهایی معمول زندگی با واکنش ها و باورها و در برخی موارد خرافه سازی های مردم روستا درگیر می شود و ... در این فیلم محمد حسینی با شبنم قلی خانی, اتابک نادری همکاری کرده است.
