محمد ناجی به عنوان بازیگر در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
گل سرخ درباره آن است که: احمد حسابدار شرکت کویران، مأمور بردن حقوق کارگران محلی به یکی از مناطق دورافتاده مرزی در شرق کشور است. در یکی از پستهای بازرسی بین راه از او خواسته میشود تا پیرزن مریضی، عروس و برادر کوچک او را همراه خود ببرد و در یکی از روستاهای بین راه پیاده کند... توفان شن در میگیرد آنها در کویر گم می شوند و ناخواسته به قلعه متروکه ای میرسند. برخورد ساکنان قلعه با آنها باعث بروز حوادثی می شود... در این فیلم محمد ناجی با رضا ناج
...ی, سیامک اطلسی, فتحعلی اویسی, حمید تمجیدی, مرتضی پورصمدی, حمیدرضا احمدی آرا, مصطفی خرقه‌پوش, بابک بیات, محمدعلی کشاورز, رضا صابری, مینا ناجی, مهری مهرنیا, خسرو معتمدی, مسعود صادقیان, محمد رضا عظیمی, مریم بختیار, احمدرضا اسماعیل زاده, حسن فرازمند همکاری کرده است.
محمد ناجی به عنوان تدوینگر در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
دلم برای پسرم تنگ شده درباره آن است که: حمیدالله، مجاهد افغانی طی عملیاتی در خاك افغانستان بشدت مجروح می شود. او كه ضمناً مسلول نیز می باشد جهت معالجه به ایران فرستاده می شود. حمیدالله كه ضمناً پسری 12 ساله دارد او را به مادرش سپرده و راهی تهران می گردد. در غیاب حمیدالله، زن و فرزند او توسط عوامل دولتی و روسها به شهادت می رسند. حمیدالله كه با یاد همسر و تنها فرزند خود در غربت به زندگی ادامه می دهد از شهادت آنها خبر ندارد. حمیدالله سوغاتی زیادی برای پسرش خریده است تا پس از بازگشت او را خوشحال نماید. ولی سرانجام با شنیدن خبر شهادت آنها، خود نیز دارفانی را وداع می گوید. فیلم به بررسی اجمالی زندگی مجاهدین افغانی در سنگر و در هجرت می پردازد. در این فیلم محمد ناجی با مهدی شجاعی, زهره امیری, محمدرضا عالی پیام, جهانسوز فولادی, علیرضا زارع میرک آباد, اسدی, حسین عسگری, میرزایی, آذر رضائی, محمدرضا ثقفی, شیکر, مجید زاهدی, مهدی زاهدی, حمید زاهدی, سعید زاهدی همکاری کرده است.
دندان طلا درباره آن است که: علی‌اکبر، روستایی ساده‌دل، برای اولین بار یک جفت دندان مصنوعی را از شهر به دِه دورافتادهٔ خود وارد می‌کند… در این فیلم محمد ناجی با جمشید مشایخی, باقر صحرارودی, افسانه چهره آزاد, رضا کرم رضایی, رضا جودی, عباس محبی, سپند امیرسلیمانی, سعید امیرسلیمانی, حسن زاهدی, مریم معترف, سیدمحمد میرزمانی, بیژن محتشم, مهدی کاشانیان, امیر نوروزی, مهدی جمشیدی, روح‌الله مفیدی, حسن شجاع, احمد گودرزی, طاهره سری, حسین فردرو همکاری کرده است.
محمد ناجی به عنوان تهیه کننده در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
پرواز درباره آن است که: داستان زندگی مردی به نام پرهام را به تصویر می كشد كه از همان نوجوانی بلند پرواز بوده و آرزو داشته یك شبه پولدار شود اما هم اكنون پس از گذشت سال ها او به همراه همسرش در یك آژانس هواپیمایی مشغول كار شد در صورتی كه به شغلش هیچ علاقه ای ندارد و همین موضوع آغاز ماجراهایی جدید در زندگی او می شود كه ... در این فیلم محمد ناجی با امیر ادیب‌پرور, افشین عزیزی, زهره حمیدی, مهرنوش طبیبی, منصور شهبازی, خاطره حاتمی, سیاوش خیرابی, محمد حمزه ای, مهدی کیا همکاری کرده است.
بندباز درباره آن است که: دانیال و آذین قصد ازدواج دارند، اما دیدار اتفاقی آذین و خواستگار سابقش هروی، تردیدهایی در این میان به وجود می‌آورد. رفتارهای عجیب آذین، دانیال را دچار نگرانی می‌کند و از طرف دیگر پیدا شدن داروهایی در اتاق آذین، به این نگرانی دامن می‌زند. مادر آذین برای دانیال شرح می‌دهد که آذین در دوران کودکی در کردستان شیمیایی شده و . . . در این فیلم محمد ناجی با آتیلا پسیانی, بابک حمیدیان, کاظم معصومی, محمود عزیزی, سمانه پاکدل, امیر شاهوردی, سودابه بیضایی, مینا نوروزی, محمد افسری, رضا کشاورز, مهران روحانی همکاری کرده است.
