محسن توکلی به عنوان تدوینگر در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
باغ فردوس، ٥ بعدازظهر درباره آن است که: دریا دختری جوان، پرشور، باهوش و با استعدادی فراوان از مشکلات روانی رنج می‌برد. مشکلات روانی او که ریشه در شرایط خانوادگی او دارد به تدریج در رویارویی با آدم‌های دور و برش در جامعه گسترش می‌یابد. با ورود یک دکتر روانشناس به زندگی دریا ماجراها شکلی دیگر به خود می‌گیرد و… در این فیلم محسن توکلی با آزیتا حاجیان, حامد بهداد, لادن مستوفي, رضا کیانیان, سیامک شایقی, غلامرضا آزادی, سعید شهرام, مهری شیرازی
..., بابک برزویه, فاضل ژیان, مازیار شیخ محبوبی, سید جواد یحیوی, مژگان ربانی همکاری کرده است.
محسن توکلی به عنوان کارگردان در برخی فیلمها مشارکت کرده است:
این زن حقش را می‌خواهد درباره آن است که: زنی به نام فرزانه قربانی اسیدپاشی می شود و فیلم داستان این زن برای احقاق حقوقش پس از این دوران را بازگو می نماید. در این فیلم محسن توکلی با افسانه پاکرو, لعیا زنگنه, میترا حجار, مینا جعفر زاده, کامران تفتی, بابک کایدان, علی فداکار, محسن روشن, رضا آشتیانی, روشنک عجمیان, آرمان موسی‌پور, رسول توکلی, حسن سلطانی, ناصر شعبانی, حمید اسلامی, محمد ضیایی همکاری کرده است.
انسانها درباره آن است که: تصادف کودکی دو خانواده را درگیر اتفاقاتی می کند. این تصادف آنها را به تعریف جدیدی از دنیای امروزی انسانها دعوت می کند در این فیلم محسن توکلی با مهدی احمدی, ترلان پروانه, حسن جوهرچی, نفیسه روشن, مهدی امينی خواه, محمد فضیله همکاری کرده است.
دوربین درباره آن است که: داستان دو دوست به نامهای مجید و حامد را روایت می کند که درگیر مشکلات یکدیگر می شوند و همین امر آنها را وارد ماجرای پلیسی پیچیده ای می کند. در این فیلم محسن توکلی با بهنوش بختیاری, شاهرخ استخری, پوریا پورسرخ, رضا رویگری, محمد محمدعلی, سارا منجزی, مجید یوسفی, علیرضا باقربیگی, حمید اسلامی, فرزام گلسفیدی, هلیا امامی, شیوا عراقی, مهدی ستاری, داریوش رعیت, مصطفی غلامی آبادانی, سعید مطلبی همکاری کرده است.
اخراجی ها 3 درباره آن است که: جنگ تمام شده، اخراجی ها و دیگر هم‌رزمانش به شهر برگشتند و هر کس در پی کسب و کاری است، یک برنامه زنده تلویزیونی در تلاش است تا تعدادی از رزمندگان را برای حضور در یک برنامه دعوت کند، شرایط نامساعد حال یکی از همرزمان او را راهی بیمارستان می کند، اما بر اثر حوادثی در سطح شهر دیر به بیمارستان می رسد و تا پای شهادت پیش می رود و این بهانه ای برای حضور همرزمان سابق در بیمارستان می شود که حالا هر یک‌شان و شخصیتی جدید دارند و... در این فیلم محسن توکلی با اکبر عبدی, امین حیایی, بهنوش بختیاری, سیدجواد هاشمی, مهران رجبی, نگار فروزنده, رز رضوی, نیما شاهرخ شاهی, امیر نوری, محمدرضا شریفی نیا, قاسم زارع, لیلا اوتادی, علیرضا اوسیوند, علی دهکردی, مریم کاویانی, مریم سلطانی, فخرالدین صدیق شریف, مسعود ده‌نمکی, بهنام ابطحی, سید حسام نواب‌صفوی, فرشاد گلسفیدی, حسن روح پروری, بابک اخوان, سپند امیرسلیمانی, احمد پورمخبر, رضا رویگری, محمود مقامی, بابک برزویه, علیرضا علویان, ایمان امیدواری, یوسف صیادی, حلیمه سعیدی, شهربانو موسوی, سیروس کهوری نژاد, ماشالله شاه مرادی زاده, ابوالفضل همراه همکاری کرده است.
پاتو زمین نذار درباره آن است که: داستان مردی است كه از قدرت و وضعیت مالی خوبی برخوردار است اما اتفاقی باعث دگرگونی و تحول در زندگی او می شود.... در این فیلم محسن توکلی با ایرج قادری, شیلا خداداد, حبیب اسماعیلی, مهدی سلوکی, جهانگیر میرشکاری, سیروس تسلیمی, ستار اورکی, حسین ملکی, مهرانه مهین ترابی, مهین نویدی, میر‌طاهر مظلومی, شهریار کلهر, فرخنده فرمانی زاده, حشمت آرمیده, شهرام تیموریان, محمد فوقانی, مهدی تهرانی, سحر ریحانی همکاری کرده است.
قرار بعدی همین جا درباره آن است که: ماجرای ازدواج جوانان... در این فیلم محسن توکلی با نیما شاهرخ شاهی, پوریا پورسرخ, مهدی مقدم, رضا رویگری, اصغر پورهاجریان, صدف طاهریان, آرمان موسی‌پور, حمید اسلامی, مونا فرجاد, محمد فضیله, هلیا امامی, عباس شیر محمدی, ملیحه روشن همکاری کرده است.
سایر فیلم ها عبارتند از:
دایناسور, آوای زندگی, ایکس لارج, طلاق به سبک ایرونی, زمزمه بودا, موارد مشکوک, قبر مشترک, عاشقی با اعمال شاقه, تایماز موتوری, طلاق به سبک ایرانی, دامادی به نام صفر, عهد شکنی
بیشتر
